Para ampliar o desenvolvimento das atividades de pesquisa e a formação de recursos humanos na área do Ensino, a criação do Programa de Pós-Graduação em Ensino na Saúde é fundamental e faz parte do plano de metas da UFCSPA (2009-2013). Neste sentido, impulsionado pela implementação do projeto Pró-Ensino na Saúde da UFCSPA, intitulado “Ensino na saúde, uma proposta integradora para o Sistema Único de Saúde”, financiado pela CAPES, um grupo de docentes, iniciou um trabalho visando criação de um novo programa de Pós-Graduação Stricto Sensu em nível de mestrado profissional. Grupos de pesquisa já atuantes, cadastrados no CNPq e certificados pela UFCSPA (Educação à Distância no Ensino das áreas da Saúde, Enfrentamento à Violência, Estudos em Educação e Tecnologias da Informação e Comunicação em Saúde, Humanidades & Ciências da Saúde: perspectiva multidisciplinar, GESETe – Grupo de Estudos em Saúde, Educação e Tecnologia, Grupo de Pesquisas em Psicologia e Processos de Saúde (GPS), dentre outros), que apresentam em sua essência atividades e linhas de  pesquisa articuladas com as temáticas “Educação e Formação na Saúde” e “Integração Ensino e Serviços de Saúde na Formação Profissional”, contribuíram para a construção da proposta do programa, uma vez que estes grupos apresentam na sua composição professores que fazem parte do grupo intelectual de professores permanentes e colaboradores do Programa em Ensino na Saúde.