A Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós-Graduação (ProPPG) é responsável pelas atividades de pós-graduação, pesquisa e inovação da Universidade.

Na área de pós-graduação, coordena as atividades dos programas Stricto Sensu (mestrado e doutorado), Lato Sensu (especialização) e programas de residência médica e multiprofissional. Na área da pesquisa e da inovação, promove ações de estímulo à pesquisa qualificada, é responsável pela iniciação científica e tecnológica, cataloga a produção científica, além de incentivar a inovação científica e tecnológica por meio do Núcleo de Inovação Tecnológica e Empreendedorismo em Saúde (NITE-Saúde).